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Tout le monde (grand public)

Le présent livre décrit est une synthèse bibliographique relative à la biologie de l’adaptation au stress salin et hydrique des plantes légumineuses. En particulier, la plante modèle Medicago truncatula Gaertner (la Luzerne). Ce modeste livre discute sur les légumineuses et leur intérêt environnementale ( adaptation au stress hydrique et salin), la variabilité génétique de ces plantes et aussi l'aspect génomique de la plante modèle Medicago truncatula Gaertn. Je tiens à remercier Pr HADJADJ AOUL Seghir de l’université d’Oran 1 pour ces précieux conseils afin d’élaborer ce petit livre.

 
Tout le monde (grand public)

Abstract

Le présent manuscrit à pour objectif d’initier la recherche in silico des gènes et des protéines en relation avec la salinité (salt stress) chez l’espèce diploïde qui est la légumineuse modèle Medicago truncatula d’intérêt agronomique important, en utilisant les bases de données biologiques disponibles sur le web (NCBI et EMBL EBI). Les deux banques de données, ont générés des résultats intéressants et différents en quantité et nature d’information obtenues, avec plus de résultats générés par GenBank (NCBI) par rapport à la base de donné (EMBL- EBI). La recherche de similitude de séquence chez l'espèce modèle Medicago truncatula en utilisant l’outil BLAST (Basic Local Alignment and Search Tool) a montré des similitudes de séquences significatives pour les protéines kinases (protéine kinase de type récepteur riche en cystéine) par rapport à l’espèce tétraploïde Medicago sativa, ce qui ouvre une perspective de recherche encore plus approfondie en utilisant d’autres bases de données spécialisées afin d’avoir des informations suffisantes et exploitables sur l’expression des gènes.

 
Tout le monde (grand public)
Abstract
Dans le but de mettre en évidence un chevauchement de l'expression génétique pour la tolérance au stress salin, sur des écotypes d'espèces annuelles du genre Medicago, nous avons mesuré,à deux stades de développement différents sporophytique et gamétophytique, la germination et la croissance de jeunes plantules,et des grains de pollen sous différentes concentrations de salinité. Les résultats obtenus montrent qu'une correspondance entre la comportement du sporophyte et du gamétophyte pour la tolérance et la sensibilité vis à vis du stress salin, existe chez l'écotype le plus tolérant Tru 42 de Medicago Truncatula et les écotypes les plus sensibles Pol 248 et Pol 242 de Medicago polymorpha. L'existence d'un overlapping fonctionnel entre le sporophyte et le gamétophyte pourrait expliquer ces résultats, ce qui permettrait d'envisager la possibilité d'appliquer la "sélection gamétophytique" pour ce caractère chez ces deux espèces. Au niveau sporophytique,la séparation par électrophorèse des protéines totales et des isoenzymes d'estérases,a permis de mettre en évidence des variations quantitatives et qualitatives en relation avec le stress salin.
 
 
Tout le monde (grand public)
Abstract
L’activité des estérases qui est liée au stade physiologique et métabolique de la cellule des plantes, peut être affectée par les facteurs environnementaux tels que le stress salin. La présente étude porte sur l’électrophorèse native des isoenzymes d’estérases, chez deux génotypes de deux espèces différentes du genre Medicago, l’une tolérante de l’espèce M. truncatula Gaertn, et l’autre sensible de l’espèce M. polymorpha L. L’étude de la synthèse des isoenzymes d’estérases durant la germination des graines sous différentes concentrations de salinité 0, 68, 102 et 137 mM, a montré des variations quantitatives et qualitatives spécifiques dans la synthèse de ces isoenzymes, entre les deux génotypes contrastés. Ce polymorphisme biochimique d’isoenzymes d’estérases, peut être expliqué par un polymorphisme génétique des gènes impliqués dans la tolérance au stress salin chez Medicago.
[ Modifié: samedi 16 décembre 2017, 11:03 ]
 
Tout le monde (grand public)
Abstract
Dans cette étude, nous avons utilisé le marqueur de séquence exprimée EST-SSR (MTIC 124) pour évaluer la variabilité génétique et déterminer la relation potentielle entre ce marqueur et la tolérance au stress salin, de deux génotypes contrastés de Medicago truncatula Gaertn. (Tru 131, tolérant & Jemalong, sensible). L’amplification de l’ADN isolé à partir de 10 individus de jeunes plants de chaque génotype avec les amorces d’EST-SSR (MTIC124) a produit un total de 20 amplicons. La taille des allèles détectée, varie de 100 à 280 pb. L’analyse du polymorphisme de ce locus a montré que les population du génotype Tru 131 a deux allèles, une diversité génétique de 0.32 et un PIC de 0.267. Les résultats obtenus à partir des bases de données Unigene et Uniprot sur les séquence protéiques hautement similaires avec le locus EST-SSR (MTIC 124), ont montré que ce locus code pour l’inhibiteur de la cystéine protéinase, qui est exprimée principalement au niveau des racines. Cette information suggère que ce locus est impliqué dans l’adaptation à la salinité, et il est adéquat pour l’étude et la compréhension des mécanismes de tolérance au stress salin chez Medicago truncatula Gaertn. MOTS-CLEFS: Medicago truncatula Gaertn., stress salin, marqueur moléculaire, bases de données moléculaires
[ Modifié: samedi 16 décembre 2017, 11:03 ]
 
Tout le monde (grand public)

Abstract
The study on the assessment of the variability of salt stress tolerance, focused on two contrasting genotypes of the plant M. truncatula under four levels of salt stress (distilled water as control 0; 68; 102 and 137 mM) of sodium chloride (NaCl) solution, one is tolerant (Tru 131) and the (Jemalong) the sensitive one. The data analysis of germination aptitude showed that the (Tru 131) genotype had the best germinatif ability, compared to (Jemalong). The soluble protein analysis, showed a high protein synthesis during salt stress application in the tolerant genotype compared to the sensitive one (Jemalong). The introduction of the most tolerant genotype (Tru 131) in arid and semi-arid areas in Algeria and Mediterranean regions, can improve significantly the vegetal productivity in order to ensure a good animal food and contribute to the fertilization of agricultural land.

[ Modifié: samedi 16 décembre 2017, 11:03 ]
 
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Abstract
For the analysis of seedling growth under salinity stress, it will be useful to study root growth in comparison to shoot elongation under salt stress. In this study, we assessed the variability of eleven ecotypes of M. truncatula under salt stress (137 mM) of NaCl compared to the control. Several studies are focalised in root growth and development because it is the most sensitive part of the plant and controls rapid transmission information to other plant parts. In order to assess the level of root sensitivity, we measured the shoot length to root length ratio. The Results showed that Tru 131 ecotype, with a high ratio (Root more vigorous than shoot) is more tolerant to salinity stress than the sensitive ecotypes that had a low ratio. We consider that the most tolerant Algerian ecotype Tru 11 (Tru 131) can be cultivated in saline and semi-arid areas in Algeria and Mediterranean regions in order to improve the legumes productivity and ameliorate the nitrogen fixation.
[ Modifié: samedi 16 décembre 2017, 11:03 ]
 
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Abstract
Quatre marqueurs de gènes exprimés appelés (EST-SSR) ont été utilisés pour montrer la diversité génétique chez neuf accessions de M. truncatula en les comparant avec deux génotypes contrastés au stress salin (Tru 131, tolérant et Jemalong, sensible). L'amplification d'ADN, isolé à partir d'individus (jeunes plantes) appartenant à chaque écotype en utilisant les quatre amorces (MTIC 044, MTIC 124, MTIC 077 et MTIC 335), a produit un total de 24 allèles dont la taille varie de 100 à 300 pb. Ces marqueurs de gènes exprimés, appelés EST SSR sont très polymorphes (comme par exemple MTIC 124), à l'exception du marqueur (MTIC 044) qui est le moins polymorphe. Une moyenne de six allèles par amorce a été enregistrée donnant un (PIC) modéré allant de 0,12 à 0,49 et une diversité génétique (Hi) qui varie de 0,13 à 0,48. L'analyse des dendrogrammes obtenus a montré qu'en général les Analyse Moléculaire et Phylogénétique Chez Différentes Accessions de Medicago Truncatula par Rapport à Deux Génotypes Contrastés à la Salinité en Utilisant des Marqueurs de Gènes Exprimés 66 écotypes d'origine algérienne (Tru 1, Tru 2, Tru 3, Tru 4) sont plus associées aux écotypes (Tru 5 et Tru 9) d'origine syrienne et jordanienne respectivement, certains génotypes sont associés à l'écotype (T131) jugé tolérant au stress salin comme l'écotype Tru 8 (JOR). Abstract Molecular and phylogenetic analysis of different accessions of Medicago truncatula comparing to two contrasting genotypes to salt stress using expressed sequence tag-simple repeat (EST-SSRs). Four expressed sequence tag-simple sequence repeat (EST-SSRs) primers were used to show genetic variability in nine accessions of M. truncatula comparing with two contrasting Medicago truncatula genotypes (Tru 131, tolerant and Jemalong, sensitive). The amplification of the DNA isolated from individual seedlings for each genotype with four primers (MTIC 044, MTIC 124, MTIC 077 and MTIC 335) produced a total of 24 alleles. The sizes of the alleles detected ranged from 100 to 300 bp. These EST-SSRs markers were more polymorphic than the MTIC 044 (low polymorphism). The average of 6 alleles per primers was detected and gave moderate values of polymorphic information content (PIC) ranged from 0.12 to 0.49 and genetic diversity (Hi) from 0,13 to 0,48. The clustering analysis showed that the Algerian ecotypes (Tru 1, Tru 2, Tru 3 and Tru 4) are associated with (Tru 5 and Tru 9) Syrian and Jordanian ecotypes respectively, some of these genotypes are associated with the tolerant ecotype (T131) like Tru 8 (JOR).
[ Modifié: samedi 16 décembre 2017, 11:04 ]
 
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Abstract

Four expressed sequence tag-simple sequence repeat (EST-SSRs) primers were used to show genetic variability in nine accessions of M. truncatula comparing with two contrasting Medicago truncatula genotypes (Tru 131, tolerant and Jemalong, sensitive). The amplification of the DNA isolated from individual seedlings for each genotype with four primers (MTIC 044, MTIC 124, MTIC 077 and MTIC 335) produced a total of 24 alleles. The sizes of the alleles detected ranged from 100 to 300 bp. These EST-SSRs markers were more polymorphic than the MTIC 044 (low polymorphism). The average of 6 alleles per primers was detected and gave moderate values of polymorphic information content (PIC) ranged from 0.12 to 0.49 and genetic diversity (Hi) from 0,13 to 0,48. The clustering analysis showed that the Algerian ecotypes (Tru 1, Tru 2, Tru 3 and Tru 4) are associated with (Tru 5 and Tru 9) Syrian and Jordanian ecotypes respectively and Tunisian ecotypes, some of these genotypes are associated with the tolerant ecotype (Tru 131 DZA).

[ Modifié: samedi 16 décembre 2017, 11:04 ]
 
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Abstract
Seed storage proteins from four genotypes of the plant model (Medicago truncatula) were electrophoretically separated by SDS-PAGE in order to find protein bands as markers for genotypes characterization in relation to salt stress. A total of 20 protein bands with molecular weight ranging from 10 to > 80 kD were recorded. Among the genotypes, the tolerant genotype (Tru 131) represented maximum number of protein bands (14) and the sensitive one (Tru 26) corresponded minimum number of polypeptide bands (07). Bands (13 and 14) were highly polymorphic and are exclusive to (Tru 131 and Tru 673), tolerant genotypes. The average gene diversity of seed storage protein in M. truncatula genotypes was moderate (H = 0,477) and the clustering revealed variation between these genotypes and were assembled in three groups. The variability of protein profiles suggested that these selected genotypes can be a good source for crop improvement through hybridization programs.

[ Modifié: samedi 16 décembre 2017, 11:04 ]
 
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