Enseignants de l'Université d'Oran 1 Ahmed Ben Bella

Le présent livre décrit est une synthèse bibliographique relative à la biologie de l’adaptation au stress salin et hydrique des plantes légumineuses. En particulier, la plante modèle Medicago truncatula Gaertner (la Luzerne). Ce modeste livre discute sur les légumineuses et leur intérêt environnementale ( adaptation au stress hydrique et salin), la variabilité génétique de ces plantes et aussi l'aspect génomique de la plante modèle Medicago truncatula Gaertn. Je tiens à remercier Pr HADJADJ AOUL Seghir de l’université d’Oran 1 pour ces précieux conseils afin d’élaborer ce petit livre.

Abstract

Le présent manuscrit à pour objectif d’initier la recherche in silico des gènes et des protéines en relation avec la salinité (salt stress) chez l’espèce diploïde qui est la légumineuse modèle Medicago truncatula d’intérêt agronomique important, en utilisant les bases de données biologiques disponibles sur le web (NCBI et EMBL EBI). Les deux banques de données, ont générés des résultats intéressants et différents en quantité et nature d’information obtenues, avec plus de résultats générés par GenBank (NCBI) par rapport à la base de donné (EMBL- EBI). La recherche de similitude de séquence chez l'espèce modèle Medicago truncatula en utilisant l’outil BLAST (Basic Local Alignment and Search Tool) a montré des similitudes de séquences significatives pour les protéines kinases (protéine kinase de type récepteur riche en cystéine) par rapport à l’espèce tétraploïde Medicago sativa, ce qui ouvre une perspective de recherche encore plus approfondie en utilisant d’autres bases de données spécialisées afin d’avoir des informations suffisantes et exploitables sur l’expression des gènes.

Abstract
The study on the assessment of the variability of salt stress tolerance, focused on two contrasting genotypes of the plant M. truncatula under four levels of salt stress (distilled water as control 0; 68; 102 and 137 mM) of sodium chloride (NaCl) solution, one is tolerant (Tru 131) and the (Jemalong) the sensitive one. The data analysis of germination aptitude showed that the (Tru 131) genotype had the best germinatif ability, compared to (Jemalong). The soluble protein analysis, showed a high protein synthesis during salt stress application in the tolerant genotype compared to the sensitive one (Jemalong). The introduction of the most tolerant genotype (Tru 131) in arid and semi-arid areas in Algeria and Mediterranean regions, can improve significantly the vegetal productivity in order to ensure a good animal food and contribute to the fertilization of agricultural land.

Abstract

Four expressed sequence tag-simple sequence repeat (EST-SSRs) primers were used to show genetic variability in nine accessions of M. truncatula comparing with two contrasting Medicago truncatula genotypes (Tru 131, tolerant and Jemalong, sensitive). The amplification of the DNA isolated from individual seedlings for each genotype with four primers (MTIC 044, MTIC 124, MTIC 077 and MTIC 335) produced a total of 24 alleles. The sizes of the alleles detected ranged from 100 to 300 bp. These EST-SSRs markers were more polymorphic than the MTIC 044 (low polymorphism). The average of 6 alleles per primers was detected and gave moderate values of polymorphic information content (PIC) ranged from 0.12 to 0.49 and genetic diversity (Hi) from 0,13 to 0,48. The clustering analysis showed that the Algerian ecotypes (Tru 1, Tru 2, Tru 3 and Tru 4) are associated with (Tru 5 and Tru 9) Syrian and Jordanian ecotypes respectively and Tunisian ecotypes, some of these genotypes are associated with the tolerant ecotype (Tru 131 DZA).

Abstract
Seed storage proteins from four genotypes of the plant model (Medicago truncatula) were electrophoretically separated by SDS-PAGE in order to find protein bands as markers for genotypes characterization in relation to salt stress. A total of 20 protein bands with molecular weight ranging from 10 to > 80 kD were recorded. Among the genotypes, the tolerant genotype (Tru 131) represented maximum number of protein bands (14) and the sensitive one (Tru 26) corresponded minimum number of polypeptide bands (07). Bands (13 and 14) were highly polymorphic and are exclusive to (Tru 131 and Tru 673), tolerant genotypes. The average gene diversity of seed storage protein in M. truncatula genotypes was moderate (H = 0,477) and the clustering revealed variation between these genotypes and were assembled in three groups. The variability of protein profiles suggested that these selected genotypes can be a good source for crop improvement through hybridization programs.